Um serviço que foi cada vez mais aprimorado no decorrer dos anos, na JFTO, é o mutirão de audiências dos juizados especiais federais, seja na SJTO ou nas subseções judiciárias de Araguaína e Gurupi. Em 2011, foi montado uma estrutura que envolveu sete juízes federais, 80 servidores e parceiros como o Exército, Governo do Estado, Sistema S, CAIXA e a  Prefeitura de Palmas. A iniciativa possibilitou o julgamento de aproximadamente 1.700 processos e o atendimento de mais de cinco mil pessoas. Também foram prestados serviços sociais.