Um ano após a chegada da Justiça Federal na cidade de Alagoinhas, no dia 20
de abril de 2012, aquela Subseção Judiciária passou a funcionar em uma nova sede na última sexta-feira, 19 de abril de 2013. A solenidade de inauguração na nova sede contou com a presença do presidente do Tribunal Regional Federal da 1ª Região, desembargador federal Mário César Ribeiro, do juiz federal diretor do Foro da Seção Judiciária da Bahia, juiz federal Ávio Novaes, e o juiz federal da Subseção de Alagoinhas, Cristiano Miranda de Santana. Também prestigiou o evento, a coordenadora dos Juizados Especiais Federais da 1ª Região, desembargadora federal, Neuza Alves.
A solenidade de inauguração ocorreu no Hotel Áster, com descerramento da placa inaugural, após a solenidade, na sede da Subseção, na Rua Silva Jardim, s/n.